动荡的幕末世代,敌我双方攻伐不断,此消彼长,期间更有无数豪杰高手涌现,共同书写着豪迈壮观的明治维新史。在这些人中间,维新一派的传奇剑客刽子手拔刀斋声名显赫,但是随着新时代的到来,他的身姿也仿佛隐没在历史的长河之中。明治11年,日本东京。一名称为“刽子手拔刀斋”的男人出现在街头,他毫无理由地斩杀路人,引得人心惶惶。从先父手中继承了神谷道场的美丽女孩神谷薫 ( 武井咲 饰)不顾个人安危,鲁莽地走上街头寻找拔刀斋,危难关头,幸亏一个路过的男人将其救下。而这个男人,正是消失了已久的拔刀斋本人——绯村剑心 ( 佐藤健 饰)。自明治维新成功以来,他立下绝不再杀害一人的誓言,隐姓埋名,带着一把逆刃刀独自在各地流浪。而假冒拔刀斋之名作恶的,则是受雇于黑心实业家武田观柳 ( 香川照之 饰)的保镖鹈堂刃卫 ( 吉川晃司 饰)。武田光鲜的外表下包藏着统治世界的野心,为此他操纵女医师高荷惠 ( 苍井优 饰)制作鸦片,并用贩毒赚来的巨款四处购买武器。武田的罪恶勾当早已引起前幕府新选组成员斋藤一 ( 江口洋介 饰)、现任明治政府警官藤田五郎的注意,但是在武田有实际行动之前他无法直接插手。与此同时,武田图谋攫取神谷道场附近的土地,为此他不惜残杀当地的百姓。在神谷道场短暂的盘桓中,剑心切实感到了周遭人们的痛苦,于是他和吵吵闹闹的相乐佐之助 ( 青木崇高 饰)联手,前往了有着250名护卫重兵把守的武田府邸 。